精彩看点:合成生物平台Ginkgo宣布推出酶服务,将应用于制药和诊断、食品和农业等领域
(原标题:合成生物平台Ginkgo宣布推出酶服务,将应用于制药和诊断、食品和农业等领域)
(资料图片仅供参考)
“基于‘超高通量筛选’和‘机器学习指导’的酶服务。”
近日,合成生物平台Ginkgo Bioworks宣布推出基于超高通量筛选和机器学习指导的酶服务,将为蛋白质设计以及优化的专有细菌、真菌宿主菌株提供支持。银杏酶服务解决了研发团队在开发酶方面面临的挑战,从发现新的酶活性到优化酶功能和大规模生产。
酶是有价值的生物催化剂,广泛应用于包括药品、食品、材料等行业的生产。Ginkgo的端到端酶服务支持研发领导者寻找新的酶活性以取代现有的化学合成步骤,提高酶在工业相关条件下的特异性、活性和稳定性,并优化酶的制造以降低商品成本和环境影响。 Ginkgo 广泛支持包括生物制药制造、发现在内的行业酶研发项目,包括与Aldevron的提高牛痘加盖酶的生产效率的突破性工作,这是一种用于生产 mRNA 疫苗的关键试剂。与此同时,Ginkgo最近宣布与默沙东合作开发用于活性药物成分 (API) 制造的生物催化剂。Ginkgo 的服务套件涵盖酶研发的完整端到端流程,提供酶序列、宿主菌株和制造工艺之间的协同作用,从而实现商业成功。具体而言,Ginkgo可提供的服务将包括:
1)新型酶的发现
通过 Ginkgo 极其广泛的专有和公共基因组序列数据库,发现新的酶活性并确定进一步蛋白质工程的起点。
使用 Ginkgo 的内部计算工具挖掘基因组数据库以识别数以千计的潜在命中
利用宏基因组筛选围绕现有 IP 进行设计
使用先进的超高通量筛选方法筛选候选物,以确定具有所需活性的独特酶
2)酶功能和稳定性优化使用广泛且不断扩展的进化、计算和合理蛋白质工程方法工具包来迭代提高催化活性、酶稳定性、特异性和表达
超高通量测定数据使受监督的机器学习能够显着改善酶功能
3)酶功能和稳定性优化在 Ginkgo 专有的细菌和真菌宿主中表达酶,这些宿主针对蛋白质生产进行了优化,包括下一代无甲醇毕赤酵母和低粘度黑曲霉
利用 Ginkgo 深厚的菌株工程专业知识优化 Ginkgo 高表达宿主菌株中的酶表达,量身定制以支持酶的最佳表达以降低生产成本
4)优化发酵工艺开发使用 Ginkgo 的数百个高通量微型生物反应器进行实验室规模的自动化实验设计,以快速开发发酵工艺,并取得了向商业规模转移的可靠记录
5)规模放大、工艺开发和技术转让在Ginkgo容量高达 3,000 升的设施之中进行中试规模发酵
优化下游加工和纯化方法
向其他制造合作伙伴的技术转让,包括 GMP 生产
生物催化领域的先驱 Jake Janey 博士表示:“大多数致力于开发酶的研发团队都希望将内部和外部的一系列不同服务和工具结合在一起,以使他们的酶发挥作用。Ginkgo 能够全程指导流程,为许多中间接触点提供用于开发和决策的数据和原型,这是一项巨大的增值。”生物制药制造和生命科学工具高级副总裁 Behzad Mahdavi 表示:“在 Ginkgo,我们不断努力改进我们的平台,以提供一流的服务,使我们的客户能够直面他们的研发挑战。作为一个横向平台,我们具有灵活性、广度和规模,可以为跨领域的客户提供服务生物催化、诊断等,以及他们为工艺和产品发现、开发和部署酶所需的全方位工具。凭借世界一流的表达宿主、自动化、计算设计和发酵能力,我们很高兴能与各行各业的公司合作,以比以往任何时候都更快、更可靠地将他们的酶依赖产品从概念推向市场。”
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